[UNSL] Investigadores de la UNSL trabajan en la optimización de métodos de detección de Covid-19

[Prensa UNSL]

Noticias
Universidad Nacional de San Luis
21 de abril de 2021


Investigadores de la UNSL trabajan en la optimización de métodos de
detección de Covid-19


El Dr. Maximiliano Juri Ayub y la Dra. Jimena Manzur buscan optimizar un
test de saliva para la detección de asintomáticos e identificar las
variantes de interés epidemiológico del SARS-Cov 2. En este sentido, los
investigadores del Área de Biología Molecular del Departamento de Biología
de la Facultad de Química, Bioquímica y Farmacia (FQByF), dialogaron con
Noticias UNSL sobre sus avances.

En el marco de un Proyecto Institucional financiado por el Ministerio de
Ciencia, Tecnología e Investigación y la Universidad Nacional de San Luis
(UNSL), los científicos proponen implementar, adaptar y diseñar estrategias
de Biología Molecular que puedan contribuir con herramientas diagnósticas
y/o epidemiológicas durante la pandemia por Covid-19.

¿Cuál es el objetivo de su trabajo?

Creemos que una de las funciones del sistema de Ciencia y Tecnología durante
la pandemia debe ser ampliar el menú de opciones disponibles para que las
autoridades sanitarias tomen las decisiones pertinentes. En ese marco, a
partir del estudio de una enorme cantidad de información científica generada
en corto tiempo en todo el mundo, surgen diferentes propuestas, las cuales
hay que diseñar, ensayar, validar y poner a disposición en caso que
funcionen como se espera.

Test de saliva para la detección de Covid-19

¿Qué nos pueden decir sobre la posibilidad de realizar tests de detección en
saliva?

El test diagnóstico posee tres (3) etapas: la toma de muestra, la extracción
del material genético viral y, finalmente la detección específica de genes
virales. Cada etapa tiene sus particularidades y complicaciones, sobre las
cuales se ha trabajado mucho para simplificarlas y hacerlas disponibles
masivamente. En particular, las dos (2) últimas etapas son hoy mucho más
sencillas y rápidas que al comienzo de la pandemia. La toma de muestra, sin
embargo, se ha modificado poco en esencia. Demanda personal entrenado, es
laboriosa, requiere el uso constante de material de protección, etc. Desde
un inicio se planteó el test a partir de saliva como una opción, aunque los
resultados iniciales de diversos trabajos eran poco consistentes. Hoy en día
existe cierto consenso de que la detección del virus a partir de saliva
puede ser muy útil, sobre todo como un método de vigilancia epidemiológica
en personas asintomáticas.

¿Este test de saliva está orientado hacia un público específico?

Como decíamos antes, nuestra función es mejorar, adaptar o proponer
herramientas. La decisión de cómo y cuándo aplicarlas corresponde a las
autoridades sanitarias, que analizan la situación desde una perspectiva más
amplia. Se postula en principio como un método para análisis de
asintomáticos, mediante una toma de muestra más sencilla y amigable, tanto
para el personal de salud como para el paciente. En principio se piensa con
fines de vigilancia epidemiológica más que de diagnóstico clínico.

¿Cómo sería su forma de detección?

El protocolo de extracción de material genético y detección es idéntico al
empleado actualmente para los hisopados. Esto es otra ventaja porque no
requiere modificar protocolos en funcionamiento.

¿Cuándo se podría comenzar a implementar?

El primer paso, como en cualquier posible modificación de una metodología
diagnóstica, es realizar una comparación entre el desempeño de la técnica de
referencia (en este caso el hisopado) y la modificada. En particular, el
parámetro clave a conocer es la sensibilidad. Varios trabajos científicos
recientes muestran una sensibilidad comparable a la metodología estándar,
pero eso debe ser validado localmente.

Variantes de interés epidemiológico

¿Cómo están trabajando para reconocer las cepas de SARS-Cov 2?

Uno de los últimos desafíos que han surgido es la aparición de las llamadas
variantes de interés epidemiológico. Estas consisten de linajes del SARS-Cov
2 que poseen, aparentemente, características preocupantes (en particular
mayor transmisibilidad y/o letalidad, o eventualmente escape al efecto
protector de las vacunas). Lamentablemente, en el país está confirmada la
circulación comunitaria de estas variantes.

¿En qué se distingue una cepa de la otra?

Las cepas o variantes se caracterizan por cambios (llamadas mutaciones), en
general muy pequeñas, en la información genética del virus, respecto de la
cepa original. Ocasionalmente, algunos de esos cambios, pueden generar
características preocupantes (mayor infectividad, mayor transmisibilidad,
letalidad, escape del sistema inmunológico).

¿Cómo es el procedimiento para detectar estas variantes?

El procedimiento consiste en secuenciar, mediante métodos caros y
laboriosos, el genoma completo o partes del genoma del virus, a partir de
muestras de cada paciente que se sospeche puede contener la variante (por
ejemplo, por proceder de una región con alta circulación de dicha variante).
Si bien se ha ampliado la capacidad de secuenciación en el país, este
procedimiento no puede realizarse a cada muestra, sino que se realiza sobre
muestras seleccionadas. Por lo tanto, junto a colegas de otras provincias,
estamos diseñando estrategias por metodologías más sencillas, como PCR, que
podrían implementarse para todas las muestras, y detectar «candidatas» para
la secuenciación, descartando la mayoría de las sospechosas en un paso de
tamizaje previo. Esto es posible gracias al hallazgo (a través del análisis
bioinformático de miles de genomas virales) de un laboratorio de la
Universidad de Yale, en Estados Unidos. Las variantes de interés
epidemiológico comparten entre sí algunas mutaciones, que además son más
grandes que las esperadas (ausencia de pequeñas regiones del genoma en lugar
de cambios puntuales). Estos cambios de magnitud mayor podrían, en
principio, ser detectados por PCR de manera más sencilla.

¿Cuál es la importancia de conocer el origen de cada cepa?

Lo sustancial no es el origen, sino las características de cada variante. Es
importante, sin embargo, notar que las variantes de interés epidemiológico
surgieron, no casualmente, en regiones de alta circulación viral
(Inglaterra, Brasil, Sudáfrica). Por lo tanto, la mejor manera de evitar el
surgimiento de nuevas variantes preocupantes es disminuir la circulación
viral, principalmente a través de medidas de distanciamiento y vacunación
masiva.

 

Prensa UNSL
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